Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Foxd1Q61345 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxd1Q61345 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxd1Q61345 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms