Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1eQ61290 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1eQ61290 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1eQ61290 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms