Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc9a1Q61165 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slc9a1Q61165 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc9a1Q61165 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms