Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift20Q61025 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ift20Q61025 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ift20Q61025 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms