Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klf3Q60980 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms