Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pabpn1lQ5XFR0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pabpn1lQ5XFR0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpn1lQ5XFR0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpn1lQ5XFR0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pabpn1lQ5XFR0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpn1lQ5XFR0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pabpn1lQ5XFR0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.4 ms