Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SynrgQ5SV85 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SynrgQ5SV85 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SynrgQ5SV85 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SynrgQ5SV85 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms