Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc42Q5SV66 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc42Q5SV66 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc42Q5SV66 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms