Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930512M02RikQ5SQK8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930512M02RikQ5SQK8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms