Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trdv4Q5R1A3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trdv4Q5R1A3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trdv4Q5R1A3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms