Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf354cQ571J5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf354cQ571J5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Znf354cQ571J5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Znf354cQ571J5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms