Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CenpjQ569L8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CenpjQ569L8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CenpjQ569L8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CenpjQ569L8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms