Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc84Q4VA36 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc84Q4VA36 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc84Q4VA36 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc84Q4VA36 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms