Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1nQ497L1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1nQ497L1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms