Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp48Q3V0C5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp48Q3V0C5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp48Q3V0C5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp48Q3V0C5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms