Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nhlrc4Q3UP44 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms