Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
OtulinQ3UCV8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OtulinQ3UCV8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OtulinQ3UCV8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms