Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk3Q3U3Q1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ulk3Q3U3Q1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ulk3Q3U3Q1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 457.1 ms