Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
9130409I23RikQ3TS87 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
9130409I23RikQ3TS87 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
9130409I23RikQ3TS87 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms