Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctdnep1Q3TP92 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdnep1Q3TP92 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdnep1Q3TP92 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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