Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc102aQ3TMW1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc102aQ3TMW1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms