Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Smarca4Q3TKT4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Smarca4Q3TKT4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Smarca4Q3TKT4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Smarca4Q3TKT4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Smarca4Q3TKT4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms