Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp39Q3TIX9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp39Q3TIX9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp39Q3TIX9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms