Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pde12Q3TIU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pde12Q3TIU4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pde12Q3TIU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms