Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zfp444Q3TDV8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zfp444Q3TDV8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Zfp444Q3TDV8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms