Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Col9a1Q05722 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col9a1Q05722 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col9a1Q05722 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col9a1Q05722 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms