Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RelaQ04207 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RelaQ04207 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelaQ04207 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RelaQ04207 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RelaQ04207 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms