Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Runx1Q03347 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Runx1Q03347 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms