Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp11Q02853 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mmp11Q02853 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Mmp11Q02853 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms