Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gjb4Q02738 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gjb4Q02738 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjb4Q02738 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb4Q02738 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms