Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcqQ02111 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcqQ02111 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcqQ02111 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms