Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RykQ01887 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RykQ01887 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RykQ01887 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RykQ01887 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RykQ01887 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RykQ01887 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RykQ01887 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RykQ01887 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RykQ01887 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RykQ01887 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RykQ01887 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RykQ01887 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RykQ01887 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RykQ01887 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RykQ01887 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RykQ01887 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RykQ01887 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RykQ01887 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RykQ01887 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RykQ01887 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RykQ01887 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RykQ01887 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RykQ01887 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RykQ01887 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RykQ01887 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RykQ01887 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RykQ01887 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RykQ01887 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RykQ01887 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RykQ01887 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RykQ01887 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RykQ01887 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RykQ01887 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms