Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mc1rQ01727 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms