Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EgfrQ01279 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EgfrQ01279 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EgfrQ01279 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms