Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pde1bQ01065 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pde1bQ01065 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pde1bQ01065 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde1bQ01065 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde1bQ01065 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms