Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrcdQ00LT2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PrcdQ00LT2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PrcdQ00LT2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms