Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GabpaQ00422 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GabpaQ00422 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GabpaQ00422 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms