Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp11aP98197 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp11aP98197 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp11aP98197 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp11aP98197 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms