Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lama4P97927 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lama4P97927 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lama4P97927 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Lama4P97927 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lama4P97927 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lama4P97927 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lama4P97927 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama4P97927 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lama4P97927 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lama4P97927 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms