Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lig3P97386 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lig3P97386 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig3P97386 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig3P97386 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig3P97386 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig3P97386 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig3P97386 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig3P97386 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms