Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim43cP86449 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43cP86449 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43cP86449 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43cP86449 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms