Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H3f3aP84244 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H3f3aP84244 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H3f3aP84244 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms