Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sparcl1P70663 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sparcl1P70663 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms