Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pkn1P70268 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkn1P70268 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms