Protein–RNA interactions for Protein: P70263

Ptgdr, Prostaglandin D2 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgdrP70263 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtgdrP70263 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtgdrP70263 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgdrP70263 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms