Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SbdsP70122 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SbdsP70122 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SbdsP70122 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SbdsP70122 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SbdsP70122 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms