Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps3P62908 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps3P62908 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps3P62908 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps3P62908 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps3P62908 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps3P62908 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps3P62908 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps3P62908 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rps3P62908 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps3P62908 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps3P62908 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps3P62908 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3P62908 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps3P62908 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps3P62908 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps3P62908 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps3P62908 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps3P62908 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms