Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbpl1P62340 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbpl1P62340 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbpl1P62340 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tbpl1P62340 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbpl1P62340 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tbpl1P62340 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbpl1P62340 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tbpl1P62340 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tbpl1P62340 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms