Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpd3P62320 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrpd3P62320 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms