Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrch1P62046 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrch1P62046 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrch1P62046 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrch1P62046 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms